La selección de fútbol sub-17 de Estonia Femenino es el equipo nacional de fútbol femenino de Estonia para jugadoras menores de 17 años. Es controlada por la Asociación Estonia de Fútbol y se encuentra afiliada a la UEFA. El equipo compite en el Campeonato Europeo Femenino Sub-17 de la UEFA y la Copa Mundial Femenina de Fútbol Sub-17 de la FIFA.
Estonia Sub-17 Femenino ha participado en 10 ediciones del Campeonato Europeo Femenino Sub-17 de la UEFA, pero nunca ha logrado clasificarse para la Copa Mundial Femenina de Fútbol Sub-17 de la FIFA. Su mejor resultado en el Campeonato Europeo Femenino Sub-17 de la UEFA fue llegar a la fase final en 2013.
Algunas de las jugadoras más destacadas que han representado a Estonia Sub-17 Femenino son:
El actual entrenador de Estonia Sub-17 Femenino es Martin Reim.
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