El Anagennisi Giannitsa es un club de fútbol griego de la ciudad de Giannitsa, Pella. Fue fundado en 1968 y juega en la segunda división griega, la Super League 2.
El club fue fundado por un grupo de aficionados al fútbol de Giannitsa, con el objetivo de crear un equipo que representara a la ciudad en las competiciones nacionales. El Anagennisi Giannitsa comenzó jugando en las divisiones regionales, y en 1989 logró el ascenso a la segunda división griega.
En la temporada 1992-93, el Anagennisi Giannitsa logró el ascenso a la primera división griega, la Super League. El club jugó en la máxima categoría del fútbol griego durante tres temporadas, hasta que descendió en 1996.
Después de su descenso, el Anagennisi Giannitsa volvió a jugar en la segunda división griega, donde se ha mantenido hasta la actualidad. El club ha logrado el ascenso a la primera división en dos ocasiones más, en 2003 y 2015, pero en ambas ocasiones descendió al año siguiente.
El Anagennisi Giannitsa juega sus partidos como local en el Estadio de la Ciudad de Giannitsa, que tiene una capacidad de 6.000 espectadores. El club tiene una rivalidad histórica con el PAOK Salónica, otro club de la región de Macedonia Central.
El Anagennisi Giannitsa nunca ha ganado un título importante, pero ha alcanzado la final de la Copa de Grecia en dos ocasiones, en 1990 y 1999. El club también ha participado en la Copa de la UEFA en tres ocasiones, en 1993, 1995 y 1999.