El Leviatán Fútbol Club fue un equipo de fútbol de la Ciudad de México, que participó en la Serie A de la Segunda División de México.
El equipo fue fundado en noviembre de 2020 luego de que un grupo de cinco empresarios que anteriormente habían formado el Club Mayas de la Tercera División decidieran iniciar un nuevo proyecto para competir en la Liga Premier de México, nombre con el que oficialmente es conocida la Segunda División del país.
En julio de 2021 el equipo dio a conocer a Miguel Salas como su entrenador para la primera temporada del club, además de en un principio se anunció el uso del Estadio Neza 86 como el escenario para sus partidos como local, el cual compartiría con el equipo Toros Neza de la Liga de Balompié Mexicano, sin embargo, la sede oficial del club y su centro de entrenamiento se encuentra en la Ciudad de México. En septiembre el equipo cambió su campo de juego al Estadio Jesús Martínez "Palillo" de la Ciudad de México, debido a que el estadio de Neza no fue aprobado por la Liga.
El 30 de julio de 2021 el Leviatán Fútbol Club fue anunciado oficialmente como un equipo participante en la Serie A de México, siendo colocado en el grupo 2 de esta categoría.
El equipo debutó de manera oficial el 19 de septiembre de 2021 cayendo derrotado por 3-1 ante el Club de Fútbol La Piedad. El Leviatán consiguió su primera victoria el 13 de octubre cuando derrotaron a domicilio a Escorpiones Fútbol Club con marcador de 3-4.
Desde sus inicios el equipo se ha destacado por problemas financieros y económicos, aunque ha logrado mantenerse en las competencias a diferencia de otros clubes del fútbol mexicano que han desaparecido por el mismo tipo de situaciones, sin embargo, en enero de 2023 el Leviatán Fútbol Club saltó a la fama internacional debido a que el equipo jugó su partido ante Cafetaleros de Chiapas con camisetas falsificadas del uniforme visitante utilizado por el Inter de Milán en la temporada 2021-2022, las cuales suelen ser usadas por equipos amateur, en un principio la directiva del club alegó haber sufrido el robo de las equipaciones oficiales de juego, sin embargo, posteriormente se informó que los problemas institucionales del equipo fueron la causa verdadera de la falta de uniformes oficiales para el juego.
Los problemas económicos y financieros del club continuaron, por lo que el 7 de junio de 2023 el Leviatán F. C. fue suspendido por la Liga Premier y no podrá tomar parte de la temporada 2023-2024 de la categoría.