La selección de fútbol sub-17 de Estonia es el equipo nacional de fútbol masculino que representa a Estonia en las competiciones internacionales de fútbol sub-17. El equipo está controlado por la Asociación Estonia de Fútbol, que es miembro de la UEFA. La selección sub-17 de Estonia ha participado en el Campeonato de Europa Sub-17 de la UEFA en 6 ocasiones, alcanzando las semifinales en 2009. La selección también ha participado en la Copa Mundial de Fútbol Sub-17 de la FIFA en una ocasión, en 1997.